Do đoạn Kim Đông - Tam Điệp chưa hoàn thành nên quốc lộ 12B chưa có lộ trình mới, hệ thống cột mốc vẫn tạm lấy theo lộ trình của các tuyến đường cũ như sau:

Theo quốc lộ 12B cũ

• Km 0: Quốc lộ 1A - Thành phố Tam Điệp - Ninh Bình
• Km 6: Song Mát - Thành phố Tam Điệp - Ninh Bình
• Km 11: Quỳnh Phong - Nho Quan - Ninh Bình
• Km 16: Phố Rịa, Quốc lộ 45 - Nho Quan - Ninh Bình
• Km 21: Trại Mỹ - Nho Quan - Ninh Bình
• Km 28: Thị trấn Nho Quan - Nho Quan - Ninh Bình
• Km 34: Phố Dương - Yên Thủy - Hòa Bình
• Km 45: Thị trấn Hàng Trạm - Yên Thủy - Hòa Bình
• Km 48: Đường Hồ Chí Minh - Yên Thủy - Hòa Bình
• Km 55: Đường Hồ Chí Minh - Lạc Sơn - Hòa Bình
• Km 60: Xóm Kho - Lạc Sơn - Hòa Bình
• Km 68: Thị trấn Vụ Bản - Lạc Sơn - Hòa Bình
• Km 76: Xóm Khặng - Lạc Sơn - Hòa Bình
• Km 81: Xóm Đường - Tân Lạc - Hòa Bình
• Km 90: Phố Chùa - Tân Lạc - Hòa Bình
• Km 95: Thị trấn Mường Khến, Quốc lộ 6 - Tân Lạc - Hòa Bình

Theo tỉnh lộ 480 cũ

• Km - 0,0 - Ghềnh (Mai Sơn)
• Km - 0,9 - Mai Sơn
• Km - 4,6 - Chợ Bến
• Km - 5,0 - Cầu Yên Thổ
• Km - 7,4 - Thị trấn Yên Thịnh
• Km - 11,7 - Thành Nam
• Km - 14,7 - Cầu chợ Bút
• Km - 18,0 - Ngọc Lâm
• Km - 21,7 - Lai Thành (Quốc lộ 10)

Theo tỉnh lộ ĐT 481 cũ

• Km - 0,0 - Tuy Lộc
• Km - 2,9 - Cầu Định Hóa
• Km - 6,4 - Văn Hải
• Km - 8,4 - Cầu Kim Mỹ
• Km - 12,4 - Thị trấn Bình Minh
• Km - 15,9 - Kim Đông
• Km - 19,4 - Đê Bình Minh 3